Flora di bagian barat Indonesia disebut flora Asiatis, meliputi Hutan Hujan Tropis (daun lebar, pohon besar, dan cendawan yang banyak), Hutan Musim Contohnya adalah pohon jati, pinus, dan cemara.

Flora Indonesia bagian tengah merupakan flora khas Indonesia seperti Sabana tropik (banyak dijumpai di Nusa Tenggara Barat), Stepa (padang rumput yang banyak diselingi semak-semak belukar dan banyak dijumpai di Nusa Tenggara Timur).

Sebagian besar flora Indonesia di bagian timur terdapat di wilayah Papua. Jenis vegetasinya terdiri atas hutan hujan tropik, hutan mangrove, dan hutan pegunungan.

Fauna di bagian barat garis wallace disebut fauna asiatis dengan beberapa jenis hewan seperti orang utan, harimau sumatera, gajah sumatera, dan beberapa mamalia lain bertubuh besar.

Fauna yang berada diantara garis wallace dan weber disebut fauna peralihan yang berisikan fauna endemik seperti anoa, komodo, biawak air, babi rusa.